Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms