Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SUPT7L-205ENST00000464789 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC008985.1-201ENST00000624169 2239 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CENPN-205ENST00000439957 1699 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC016747.1-201ENST00000420918 2532 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 PRLR-202ENST00000310101 1297 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 GSTA10P-201ENST00000412182 576 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL031584.2-201ENST00000420585 767 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ESRRG-222ENST00000493748 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MS4A10-201ENST00000308287 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ADA2-204ENST00000399839 3986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 PTER-203ENST00000423462 3212 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CDH18-201ENST00000274170 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL136985.3-201ENST00000637377 2219 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN3Q13064 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 EFCAB1-201ENST00000262103 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CACNB4-263ENST00000637779 1772 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MAPK10-290ENST00000641237 2826 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ARHGAP1-201ENST00000311956 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 BSPH1-201ENST00000344839 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MIR3680-2-201ENST00000578247 87 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MIR3680-1-201ENST00000581433 87 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms