Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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