Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CENPFP49454 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CENPFP49454 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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CENPFP49454 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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CENPFP49454 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CENPFP49454 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CENPFP49454 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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CENPFP49454 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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CENPFP49454 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CENPFP49454 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CENPFP49454 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CENPFP49454 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CENPFP49454 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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