Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NREPQ16612 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 CLCN3P1-201ENST00000423965 1017 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC021242.2-202ENST00000522129 545 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NREPQ16612 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms