Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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