Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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CUL4AQ13619 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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