Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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