Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 TTC21A-205ENST00000440121 3941 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 KDM4C-202ENST00000381309 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 LIPH-201ENST00000296252 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 LINC00927-203ENST00000558913 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SNORA55-201ENST00000364587 135 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 LINC02449-202ENST00000399866 517 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RPL26P34-201ENST00000431005 451 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AL731567.1-201ENST00000435635 462 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC091808.1-201ENST00000438867 786 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AL445686.1-201ENST00000443086 348 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 OR2AI1P-201ENST00000448534 932 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC239859.3-201ENST00000456469 408 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 ATP6V1G1P2-201ENST00000522436 346 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC008619.1-201ENST00000524312 567 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AP004245.1-201ENST00000530434 259 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC079031.2-201ENST00000537742 615 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC009502.1-202ENST00000606673 602 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 CARMN-212ENST00000614896 536 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AL121594.6-201ENST00000633440 261 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 MIR3191-201ENST00000636300 76 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 HLA-B-257ENST00000640094 147 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SYTL4-204ENST00000372989 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 NHSL2-208ENST00000639939 3402 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 NFRKB-202ENST00000524746 4114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 LRRC37A-202ENST00000393465 4997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 MORF4L2-203ENST00000422154 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AL135818.1-202ENST00000554096 1740 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 TFIP11-217ENST00000619735 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 TGIF2LY-201ENST00000321217 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 MAP1LC3C-201ENST00000357246 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AL133406.1-201ENST00000404904 747 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RN7SKP152-201ENST00000410444 315 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SMIM12-201ENST00000417239 684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RPSAP10-201ENST00000426103 878 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AL035417.1-201ENST00000442754 214 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 LINC00572-201ENST00000450264 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 RPL23AP66-201ENST00000494341 479 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 AC244505.1-201ENST00000502642 307 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 IGLVI-68-201ENST00000519525 345 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXB1P14653 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms