Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms