Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.6 ms