Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms