Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CBFBQ13951 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms