Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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