Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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