Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 CSE1L-AS1-201ENST00000417781 556 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 PROX1-AS1-203ENST00000451396 476 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 232 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 MAPK10-329ENST00000641555 2656 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 P2RY14-201ENST00000309170 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 HSD17B4-220ENST00000513628 2225 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
MKRN3Q13064 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC012360.3-201ENST00000610036 3449 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC009148.1-201ENST00000570148 2693 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 BCRP8-201ENST00000412037 255 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 IGLVIV-59-201ENST00000520218 250 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC010323.2-201ENST00000596405 594 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.108-201ENST00000621610 300 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 GULP1-203ENST00000409609 1932 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CABYR-206ENST00000463087 1792 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC087501.5-201ENST00000607496 2374 ntBASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ERI2-215ENST00000569729 2646 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
MKRN3Q13064 DPH6-202ENST00000440392 3648 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
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