Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN7O94888 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms