Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms