Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FXNQ16595 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FXNQ16595 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms