Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms