Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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