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| IFT88 | Q13099 | RN7SKP269-201 | ENST00000365545 | 319 nt | BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| IFT88 | Q13099 | C4orf47-201 | ENST00000378850 | 1134 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
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| IFT88 | Q13099 | AC104109.1-201 | ENST00000498563 | 436 nt | BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| IFT88 | Q13099 | LINC01365-202 | ENST00000512219 | 637 nt | TSL 5 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
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| IFT88 | Q13099 | HDAC2-AS2-217 | ENST00000523087 | 493 nt | TSL 3 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
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| IFT88 | Q13099 | LINC01708-202 | ENST00000634316 | 859 nt | TSL 5 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
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| IFT88 | Q13099 | ZEB1-202 | ENST00000361642 | 5990 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| IFT88 | Q13099 | STAG2-204 | ENST00000371157 | 5991 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| IFT88 | Q13099 | CARF-208 | ENST00000428585 | 2513 nt | TSL 2 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| IFT88 | Q13099 | KIAA0586-202 | ENST00000354386 | 5226 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| IFT88 | Q13099 | AL590399.5-201 | ENST00000428709 | 3325 nt | TSL 2 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| IFT88 | Q13099 | CEP290-202 | ENST00000397838 | 2421 nt | TSL 5 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
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| IFT88 | Q13099 | AJ009632.2-204 | ENST00000635621 | 1401 nt | TSL 5 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| IFT88 | Q13099 | ZBTB21-201 | ENST00000310826 | 7449 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| IFT88 | Q13099 | CACNB4-233 | ENST00000636773 | 4143 nt | TSL 5 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| IFT88 | Q13099 | LANCL1-204 | ENST00000441020 | 4503 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| IFT88 | Q13099 | FOXP2-204 | ENST00000390668 | 1472 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| IFT88 | Q13099 | ZZZ3-202 | ENST00000370801 | 4328 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |