Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 RN7SL233P-201ENST00000469988 277 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC006441.3-201ENST00000580121 456 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 LMLN-202ENST00000332636 1812 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 MYO1A-203ENST00000442789 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 USP32P2-201ENST00000412260 4329 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 LINC00299-201ENST00000430192 1760 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 GPD2-203ENST00000409674 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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