Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 GLRA2-201ENST00000218075 3216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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