Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms