Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRGP23470 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms