Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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