Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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