Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GDAP2Q9NXN4 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms