Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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ECM1Q16610 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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ECM1Q16610 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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ECM1Q16610 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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