Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms