Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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