Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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CUL4BQ13620 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CUL4BQ13620 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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CUL4BQ13620 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CUL4BQ13620 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CUL4BQ13620 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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CUL4BQ13620 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL4BQ13620 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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