Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE2V1Q13404 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE2V1Q13404 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE2V1Q13404 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE2V1Q13404 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
UBE2V1Q13404 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 OR2T4-202ENST00000366475 1047 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 MIR654-201ENST00000385199 81 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 OCM-202ENST00000416608 623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 RPE-213ENST00000445268 668 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 RN7SL549P-201ENST00000478997 282 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC114300.1-201ENST00000502347 280 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 LINC02200-203ENST00000513687 541 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 RPL35AP25-201ENST00000584631 330 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 MIR7847-201ENST00000610912 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC244517.9-201ENST00000624102 434 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 AC073862.2-201ENST00000625114 701 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
UBE2V1Q13404 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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