Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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PTP4A2Q12974 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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PTP4A2Q12974 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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PTP4A2Q12974 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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