Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPS29P62273 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
RPS29P62273 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
RPS29P62273 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
RPS29P62273 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RPS29P62273 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RPS29P62273 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms