Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SPATA31D5P-201ENST00000376459 4784 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PTPN3-204ENST00000446349 8630 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 THSD7B-201ENST00000272643 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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