Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM187BQ17R55 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms