Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
GAPVD1Q14C86 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GAPVD1Q14C86 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms