Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms