Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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