Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NME3Q13232 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NME3Q13232 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms