Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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