Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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HOXD13P35453 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXD13P35453 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXD13P35453 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXD13P35453 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXD13P35453 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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