Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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PTPRMP28827 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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