Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms