Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms