Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms