Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
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