Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms